In 1304 was voor het eerst sprake van een neerhof met toren en toegangspoort op de plaats van het huidige Blauw kasteel. Het oorspronkelijk kasteel, vermoedelijk gebouwd in de late middeleeuwen, werd in 1780 vervangen door nieuw classicistisch kasteel opgetrokken in blauwe hardsteen, vandaar de naam “Blauw Kasteel”.
In 1911 werd op het domein van het Blauw Kasteel de bronwater- en limonadefabriek “Windeke Bron” gesticht door Ernest Vergauwen, burgemeester van Scheldewindeke, die het kasteel erfde van zijn vader. In de omgeving van het Blauw Kasteel bestonden talrijke ondergrondse waterlagen. Uit deze waterbronnen verkregen ze natuurlijk mineraalwater voor de waters en limonade. In 1922 koopt houthandelaar Augustinus Hul het domein. Hij verhuurt het kasteel zelf tijdelijk aan een sociale organisatie die arme kinderen er een aangename vakantie wilde bezorgen. In 1930 trekt Augustinus Hul samen met zijn zoon Leonce in het kasteel. In 1933 werd de brouwerij Hul opgericht. De limonadefabriek werd verder uitgebaat door Leonce Hul. De bierbrouwerij verhuisde enkele jaren later naar Merelbeke. De limonadefabriek bleef werkzaam tot 1976.
In 1957 was het hoofdgebouw van het kasteel erg in verval geraakt. Met het oog op herbouw werd het kasteel steen voor steen afgebroken. Enkel de twee zijgebouwen bleven staan en werden gebruikt als dienstgebouwen en stallingen.
Sinds 2003 is het domein in handen van Peter Denoo die het kasteel opnieuw in zijn oude glorie herstelde. Sinds 2007 wordt er op het domein aan biologische groenteelt gedaan onder de naam 'Bioboerderij Blauw Kasteel'.